ข้าวสาลีเผยแพร่ทรัพยากรที่สำคัญให้กับชุมชนวิทยาศาสตร์

ข้าวสาลีเผยแพร่ทรัพยากรที่สำคัญให้กับชุมชนวิทยาศาสตร์

หลังจากการประกาศในเดือนมกราคม 2016 เกี่ยวกับการผลิตส่วนประกอบจีโนมทั้งหมดสำหรับข้าวสาลีขนมปัง ขณะนี้ International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC) ซึ่งควบคุมคุณภาพได้เสร็จสิ้นแล้ว กำลังทำให้ทรัพยากรที่ก้าวล้ำนี้พร้อมใช้งานสำหรับนักวิจัยผ่านทางที่เก็บลำดับข้าวสาลี IWGSC ที่ URGI- INRA-แวร์ซายส์ ประเทศฝรั่งเศสนักเพาะพันธุ์ข้าวสาลีและ

นักวิทยาศาสตร์ทั่วโลกจะสามารถดาวน์โหลด

และใช้ทรัพยากรใหม่ที่ทรงคุณค่านี้เพื่อเร่งโครงการปรับปรุงพืชผลและการวิจัยจีโนมของข้าวสาลี ชุดข้อมูลนี้จะอำนวยความสะดวกในการระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะทางการเกษตรที่สำคัญ เช่น การเพิ่มผลผลิต การตอบสนองต่อความเครียด และการต้านทานโรค และท้ายที่สุดจะทำให้การผลิตข้าวสาลีพันธุ์ปรับปรุงสำหรับเกษตรกรเป็นไปได้ตั้งแต่การประกาศในเดือนมกราคม ทีมงานโครงการ 

IWGSC ได้ปรับแต่งข้อมูลเพื่อให้ชุดจีโนม

ที่เผยแพร่สู่ชุมชนวิทยาศาสตร์มีคุณภาพสูงสุดเท่าที่จะเป็นไปได้ ทรัพยากรที่เผยแพร่ในวันนี้ อิงตามข้อมูลการจัดลำดับของ Illumina ที่ประกอบกับซอฟต์แวร์ DeNovoMAGICTM ของ NRGene แสดงถึงจีโนมข้าวสาลีที่มีความซับซ้อนสูงได้มากกว่า 90 เปอร์เซ็นต์ มียีนที่รู้จักมากกว่า 97 เปอร์เซ็นต์ และกำหนดข้อมูลให้กับโครโมโซมข้าวสาลี 21 โครโมโซม

การเปิดเผยข้อมูลนี้แสดงถึงความพยายาม

อย่างต่อเนื่องของ IWGSC ในการสร้าง “ลำดับอ้างอิงมาตรฐานทองคำ” ซึ่งเป็นแผนที่ที่สมบูรณ์ของจีโนมทั้งหมดที่จัดตำแหน่งของยีนทั้งหมดและโครงสร้างจีโนมอื่นๆ อย่างแม่นยำตามโครโมโซมข้าวสาลี 21 โครโมโซม จีโนมข้าวสาลีมีขนาดใหญ่ – ห้าเท่าของจีโนมมนุษย์ – และซับซ้อน มีโครโมโซมเจ็ดชุด

สามชุด“นโยบายของ IWGSC 

คือการเปิดเผยข้อมูลทั้งหมดต่อสาธารณะทันทีที่ผ่านการตรวจสอบคุณภาพ” Kellye Eversole ผู้อำนวยการบริหารของ IWGSC อธิบาย “ด้วยการทำเช่นนั้น ชุมชนวิทยาศาสตร์สามารถเริ่มใช้ประโยชน์จากข้อมูลได้ในขณะนี้ ในขณะที่ Consortium กำลังดำเนินไปสู่ลำดับอ้างอิงมาตรฐานทองคำ ซึ่งคาดว่าจะเผยแพร่ในปี 2560”ในอีกไม่กี่เดือนข้างหน้า ทีมงานโครงการ IWGSC จะยังคง

ทำงานต่อไปเพื่อให้ได้ลำดับจีโนมข้าวสาลี

ที่มีคุณภาพสูง ซึ่งประกอบด้วยการใส่คำอธิบายประกอบและการระบุตำแหน่งที่แม่นยำของยีน องค์ประกอบด้านกฎระเบียบ และเครื่องหมายตามโครโมโซม ซึ่งจะเป็นการจัดหาเครื่องมือที่ทรงคุณค่าสำหรับ พ่อพันธุ์แม่พันธุ์ข้าวสาลี ผลลัพธ์สุดท้ายจะรวมทรัพยากรจีโนมทั้งหมดที่ผลิตขึ้นภายใต้ร่มของ IWGSC ในช่วงทศวรรษที่ผ่านมา รวมถึงแผนที่ทางกายภาพและ

พันธุกรรมของแต่ละบุคคล

ผ่านโครงการวิจัยจีโนมพืชมูลนิธิวิทยาศาสตร์แห่งชาติของสหรัฐอเมริกา คณะกรรมาธิการข้าวสาลีแห่งแคนซัส สำนักงานเกษตรและอาหารแห่งสหพันธรัฐเยอรมัน, กระทรวงอาหารและเกษตรแห่งสหพันธรัฐเยอรมัน; INRA, มหาวิทยาลัยเบลส ปาสคาล; อิลลูมินา อิงค์; และผู้สนับสนุน IWGSC

Credit : สล็อต